Frontier Bioinformatics Laboratory
ゲノム解析・機械学習・大規模シミュレーションを統合し、 疾患の発症メカニズムから創薬標的の探索まで—— データ駆動の視点で生命科学の根本問題に挑みます。
筑波科学大学 生命環境系 ／ つくば市天王台
Principal Investigator: 佐倉 理生 教授（Ph.D.）
Since 2014
論文 128 報 ／ 在籍 19 名
About the Lab
「測れないものは、理解できない」
を、出発点に。
当研究室は、次世代シーケンサーが生み出す膨大なゲノム・トランスクリプトームデータと、 機械学習・統計モデリングの手法を橋渡しすることで、これまで観察できなかった生命現象を 定量的に捉えることを目指しています。基礎研究にとどまらず、得られた知見を 臨床・創薬の現場へ還元する「橋渡し研究」を一貫して重視しています。
学際性を大切にし、生物学・情報学・医学・統計学の異なる背景を持つメンバーが 日々議論を交わしています。研究の自由と再現性、そして次世代の育成を、 研究室運営の三本柱としています。
128
査読付き論文（累計）
¥4.2億
外部研究資金（科研費等）
31
修了生の進路（産・学）
Research
3つの研究軸を相互に往復させながら、データから仮説へ、仮説から検証へとつなげています。
Theme 01
がん・神経変性疾患を対象に、ゲノム・エピゲノム・発現データを統合解析し、 発症に関わる分子ネットワークを再構築します。
Theme 02
解釈可能性と再現性を備えた予測モデルを設計し、配列・構造・画像データに 適用可能な汎用フレームワークを開発しています。
Theme 03
製薬企業・医療機関との共同研究を通じ、計算で得た標的候補を 実験・臨床データで検証するパイプラインを構築します。
Members
教員 3 名／研究員 2 名／大学院生 11 名／学部生 3 名
Principal Investigator
教授／生命環境系・先端生命情報科学研究室 主宰
東京大学大学院理学系研究科修了。理化学研究所、米国スタンフォード大学を経て現職。 専門は計算ゲノム科学・統計的機械学習。日本バイオインフォマティクス学会理事。 「データに語らせる前に、問いを磨く」を信条とする。
峰岸 千尋
准教授
エピゲノミクス／一細胞解析
久我 駿
助教
深層学習／タンパク質構造
研究員 2 名
特任研究員
創薬インフォマティクス
Publications & Awards
直近の代表的な原著論文と受賞を抜粋して掲載しています。 全業績リストは researchmap・Google Scholar をご参照ください。
業績一覧を見るSakura R., Minegishi C., et al. “Interpretable deep models reveal cryptic regulatory grammar in cancer genomes.” Nature Methods.
Kuga S., Sakura R. “A reproducible benchmark for single-cell trajectory inference.” Genome Biology.
峰岸 千尋 ほか「一細胞エピゲノム解析による細胞分化軌道の再構成」日本分子生物学会年会 優秀発表賞。
Sakura R., et al. “Data-driven discovery of druggable targets in neurodegeneration.” Cell Systems.
Join Us
大学院生（修士・博士）、博士研究員、共同研究を随時募集しています。 生物学・情報学いずれの出身でも構いません。プログラミング未経験から 論文化まで伴走する教育体制を整えています。研究室見学は随時受け付けています。
見学・相談を申し込む大学院生（修士・博士）
夏・冬の入試前に研究室訪問を推奨。事前にメールでご連絡ください。
博士研究員（ポスドク）
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共同研究・受託解析
企業・医療機関からのデータ解析のご相談を歓迎します。
Contact
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通常2〜3営業日以内にご返信いたします。
contact@frontier-bioinfo.example.ac.jp
Address
茨城県つくば市天王台 1-1-1
筑波科学大学 生命環境系 B棟